Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

Контиг від англ contiguous набір сегментів ДНК що перекриваються які в сукупності являють собою консенсусну ділянку ДНК

Контиг

Контиг

Контиг (від англ. contiguous) — набір сегментів ДНК, що перекриваються, які в сукупності являють собою консенсусну ділянку ДНК.

image
Фрагменти, що перекриваються, утворюють контиги, контиги з проміжками відомої довжини утворюють скаффолди

У задачі складання геному контиги — це довгі ділянки ДНК (рядки з нуклеотидів), отримані в процесі складання.

Послідовності

Контиг — це неперервна (не суміжна) послідовність, що виникає внаслідок повторного складання дрібних фрагментів ДНК, створених методом секвенування знизу вгору. Це визначення контигу узгоджується з початковим визначенням Роджера Стадена 1979 року. Стратегія секвенування ДНК знизу вгору передбачає розрізання геномної ДНК на безліч дрібних фрагментів («знизу»), секвенування цих фрагментів, повторне їх складання назад у контиги і, зрештою, у весь геном («вгору»). Оскільки нинішня технологія дозволяє здійснювати пряме секвенування лише порівняно коротких фрагментів ДНК (300—1000 нуклеотидів), перед секвенуванням геномну ДНК слід фрагментувати на невеликі шматочки.

Нині широко використовується технологія «секвенування парних кінців», у якій секвеновано довші фрагменти ДНК однакового розміру.

Див. також

Примітки

  1. Gregory, S. Contig Assembly. Encyclopedia of Life Sciences, 2005
  2. Dear, P. H. Genome Mapping. Encyclopedia of Life Sciences, 2005. DOI:10.1038/npg.els.0005353.
  3. Staden R (1979). A strategy of DNA sequencing employing computer programs. Nucleic Acids Research. 6 (7): 2601—2610. doi:10.1093/nar/6.7.2601. PMC 327874. PMID 461197.
  4. Dunham, I. Genome Sequencing. Encyclopedia of Life Sciences, 2005.
В іншому мовному розділі є повніша стаття Contig(англ.). Ви можете допомогти, розширивши поточну статтю за допомогою з англійської.
  • Дивитись автоперекладену версію статті з мови «англійська».
  • Перекладач повинен розуміти, що відповідальність за кінцевий вміст статті у Вікіпедії несе саме автор редагувань. Онлайн-переклад надається лише як корисний інструмент перегляду вмісту зрозумілою мовою. Не використовуйте невичитаний і невідкоригований машинний переклад у статтях української Вікіпедії!
  • Машинний переклад Google є корисною відправною точкою для перекладу, але перекладачам необхідно виправляти помилки та підтверджувати точність перекладу, а не просто скопіювати машинний переклад до української Вікіпедії.
  • Не перекладайте текст, який видається недостовірним або неякісним. Якщо можливо, перевірте текст за посиланнями, поданими в іншомовній статті.
  • Докладні рекомендації: див. .

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

Kontig vid angl contiguous nabir segmentiv DNK sho perekrivayutsya yaki v sukupnosti yavlyayut soboyu konsensusnu dilyanku DNK Fragmenti sho perekrivayutsya utvoryuyut kontigi kontigi z promizhkami vidomoyi dovzhini utvoryuyut skaffoldi U zadachi skladannya genomu kontigi ce dovgi dilyanki DNK ryadki z nukleotidiv otrimani v procesi skladannya PoslidovnostiKontig ce neperervna ne sumizhna poslidovnist sho vinikaye vnaslidok povtornogo skladannya dribnih fragmentiv DNK stvorenih metodom sekvenuvannya znizu vgoru Ce viznachennya kontigu uzgodzhuyetsya z pochatkovim viznachennyam Rodzhera Stadena 1979 roku Strategiya sekvenuvannya DNK znizu vgoru peredbachaye rozrizannya genomnoyi DNK na bezlich dribnih fragmentiv znizu sekvenuvannya cih fragmentiv povtorne yih skladannya nazad u kontigi i zreshtoyu u ves genom vgoru Oskilki ninishnya tehnologiya dozvolyaye zdijsnyuvati pryame sekvenuvannya lishe porivnyano korotkih fragmentiv DNK 300 1000 nukleotidiv pered sekvenuvannyam genomnu DNK slid fragmentuvati na neveliki shmatochki Nini shiroko vikoristovuyetsya tehnologiya sekvenuvannya parnih kinciv u yakij sekvenovano dovshi fragmenti DNK odnakovogo rozmiru Div takozhSkladannya genomuPrimitkiGregory S Contig Assembly Encyclopedia of Life Sciences 2005 Dear P H Genome Mapping Encyclopedia of Life Sciences 2005 DOI 10 1038 npg els 0005353 Staden R 1979 A strategy of DNA sequencing employing computer programs Nucleic Acids Research 6 7 2601 2610 doi 10 1093 nar 6 7 2601 PMC 327874 PMID 461197 Dunham I Genome Sequencing Encyclopedia of Life Sciences 2005 V inshomu movnomu rozdili ye povnisha stattya Contig angl Vi mozhete dopomogti rozshirivshi potochnu stattyu za dopomogoyu perekladu z anglijskoyi Divitis avtoperekladenu versiyu statti z movi anglijska Perekladach povinen rozumiti sho vidpovidalnist za kincevij vmist statti u Vikipediyi nese same avtor redaguvan Onlajn pereklad nadayetsya lishe yak korisnij instrument pereglyadu vmistu zrozumiloyu movoyu Ne vikoristovujte nevichitanij i nevidkorigovanij mashinnij pereklad u stattyah ukrayinskoyi Vikipediyi Mashinnij pereklad Google ye korisnoyu vidpravnoyu tochkoyu dlya perekladu ale perekladacham neobhidno vipravlyati pomilki ta pidtverdzhuvati tochnist perekladu a ne prosto skopiyuvati mashinnij pereklad do ukrayinskoyi Vikipediyi Ne perekladajte tekst yakij vidayetsya nedostovirnim abo neyakisnim Yaksho mozhlivo perevirte tekst za posilannyami podanimi v inshomovnij statti Dokladni rekomendaciyi div Vikipediya Pereklad

Дата публікації:
Топ